Yaratık`la girişilen son maceranın ardından 200 yıl geçmiştir. Uzun yıllar boyu yapılan sekiz başarısız deneyin ardından bilimadamları Ripley ve o öldüğünde içinde olan kraliçe yaratığın bir kopyasını klonlamayı başarmışlardır. Bilimadamlarının yaratık bir taşıyıcı buluncaya kadar fark etmekte geç kaldığı bir gerçek vardır : Yaratık sandıklarından çok daha zekidir ve artık fizyolojik olarak bambaşka özelliklere sahiptir.